A sede do UNIS está localizada em Varginha, na região do Sul de Minas Gerais. A instituição também possui outras quatro unidades localizadas em cidades no mesmo estado: Cataguases, Pouso Alegre, São Lourenço e Três Pontas.
Em sua estrutura, a sede tem biblioteca, com acervo físico e virtual, centro de convivência, auditório, laboratórios de informática, de TV, de radiojornalismo, de maquetes e específicos para outras áreas.
Para os cursos da modalidade a distância, a instituição oferece polos de apoio aos alunos em dezenas de cidades, em quase todos os estados do país.