A FAMETRO possui uma rede de unidades distribuídas em diferentes regiões, abrangendo campi, faculdades e polos. Ao todo, são 4 unidades estrategicamente localizadas em áreas como Tabatinga, Nova Cidade, Leste e Cachoeirinha em Manaus, Amazonas. Além disso, a instituição possui 6 faculdades, incluindo a Faculdade Metropolitana do Pará, Tefé, Parintins, Itacoatiara, Coari no Amazonas, e a Faculdade Metropolitana de Boa Vista em Roraima, proporcionando um leque de cursos e programas especializados.
Por fim, mais de 40 polos são dispostos em em diferentes estados do país, incluindo Amazonas, Pará, Roraima, Rondônia, e até em Santa Catarina, facilitando o acesso à educação em regiões mais remotas ou com restrições de deslocamento.