A Universidade Nilton Lins está situada na cidade de Manaus, capital do Estado do Amazonas. Suas instalações ocupam uma área de 1.000.000 m², com dois campi principais: Parque das Laranjeiras e Japiim.
A estrutura integra 600 salas de aula, laboratórios especializados, uma fazenda experimental, auditórios, sendo um deles o maior da cidade com capacidade para 4.000 pessoas, além de áreas livres e um complexo desportivo.
Unido a isso, a universidade oferece bibliotecas com um acervo superior a 100.000 livros, proporcionando subsídios acadêmicos para estudantes e pesquisadores.