A sede da Unirio fica no bairro da Urca, no Rio de Janeiro (RJ). Suas outras unidades estão localizadas nos bairros cariocas da Tijuca, do Centro e de Botafogo.
Em sua infraestrutura, destacam-se laboratórios, salas de aula, bibliotecas, auditórios, hospital universitário, espaços administrativos e de atividades multiculturais e restaurante universitário. A universidade possui também um Núcleo de Apoio Psicossocial (NAP), com atendimento psicológico e nutricional para os estudantes, mediante agendamento.